目的:研究轮状病毒流行株NSP4基因变异特征。方法:对2015年7-11月从云南省昭通市获得的6株人轮状病毒流行株的NSP4基因用RT-PCR进行扩增,并进行测序,测序结果应用DNAassist和Clustal-mp以及MEG4.0软件进行序列分析,通过昭通毒株RV NSP4基因与来自GenBank Database的4株人RV (Wa、Hochi、KUN、AU-1)和3株动物RV(OSU、SAll、EW)及我国不同地区的45株A组轮状病毒NSP4基因进行比较。结果:昭通地区6株轮状病毒株的NSP4基因都为Wa型,与来自Genbank Database的4株人RV (Wa、Hochi、KUN、AU-1)和3株动物RV(OSU、SAll、EW)氨基酸同源性分别为95.7%、94.2%、86.4%、84.8%和91.2%、82.3%、48.3%,与中国各地区流行株同源性均在86.4%以上,据此可将51株RV NSP4分为2组,分别以Wa株和KUN株为代表,其中以Wa组为主,组内同源分别为92.6%-100%和96.5%-100%.氨基酸进化树提示在Wa组内包括3个亚组。结论:6个昭通地区轮状病毒株的NSP4基因都为Wa型.我国流行株NSP4基因主要可分为Wa组及KUN组,NSP4的变异与年份有关而与地域关系不密切.
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